قد يكون للعلاج بالموجات الصادمة آثار جانبية معينة. يستخدم العلاج بالموجات الصادمة عادةً موجات هوائية قوية لتحقيق تأثيرات علاجية. أثناء عملية العلاج، قد يؤدي ذلك إلى تلف الكلى وحصوات الحالب الثانوية وتوسع الحالب. قد يعاني بعض المرضى أيضًا من احمرار الأنسجة الموضعي والنزيف تحت الجلد والكدمات والألم وأعراض أخرى. لكن الغالبية العظمى من الحالات عابرة وستتحسن تدريجيًا بعد 1-2 يومًا من العلاج. يُنصح المرضى بعدم القلق كثيرًا واتباع ترتيبات الطبيب وتلقي العلاج في الوقت المناسب والتحكم في حالتهم.